7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

1/15

perbaikan ketidakcocokan

Enzim tertentu memindai DNA untukperubahan besar dalam DNA untaiganda

Ini biasanya disebabkan olehketidakcocokan basis

AG

AC CT

Ini dipotong dan DNA yang diperbaiki

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

2/15

Perbaikan denganmemotong basa

Jalur utama untuk perbaikan dari basa yangdimodikasi! kesalahan penggabungan urasil!kerusakan oksidati"

#erbagai glikosilasi dna mengenali lesi dan

menghapus basa pada ikatan glikosida$ %ehinggamenghasilkan sebuah &abasic' atau AP (apurinat )apyrimidinat* tempat dengan basa &membalik keluar'

%alah satu dari beberapa endonuklease AP

memotong backbone phosphodiesterase berbatasandengan tempat AP

AP nukleotida dihapus oleh e+onuclease ) d,Pase danditambal ulang oleh sintesis DNA dan ligasi

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

3/15

-ekanisme dari perbaikan dasar

eksisi

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

4/15

N

N

NH2

O

O

H2C

O

ON

HN

O

O

O

H2C

O

O

deo+ycytosine deo+yuracil

./

0/

1/

2/

3/

.0

12

3

4

CH3

thymine

glycosidic bond

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

5/15

Jenis lesi yang diperbaikioleh #E,

5esi oksidati"6 78o+o8G! sangat mutagenik! tidakberpasangan dengan A! memproduksi GC 89 TAtrans:irase contoh -ut ;! -ut - < =PG dari E$ coli

Deo+yuracil> dari kesalahan penggabungan dari d?

atau deaminasi dC 89 d?! contoh ?ng! urasil N8glycosylase

#erbagai produk alkilasi e$ g$ 18-ea

5esi ini tidak mendistorsi dan tidak memblokir DNA

polimeraseDepurination spontan (esp$ G* menghasilkan tempat

abasic yang diperbaiki oleh sebagian dar @alur #E,

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

6/15

-ekanisme keluar balik atau &

ipping out'

Perbaikan mismatch (--,*

-eskipun DNA disintesis dengan ketelitian yang luarbiasistem perbaikan ketidakcocokan sa! kesalahan tetapada$ Besalahan tersebut dapat dideteksi dan diperbaiki

oleh sistem perbaikan ketidakcocokan setelah replikasi$Prokariota dan eukariota menggunakan mekanisme yangsama dengan tur struktural umum$ Cacat pada --,meningkatkan tingkat mutasi spontan .8.+$ Cacatpada --, mendasari kecenderungan manusia untukkanker usus besar dan kanker lainnya (NPCC*$ --, @ugaproses kesalahan pasangan yang dihasilkan dari DNAheteroduple+ terbentuk selama rekombinasi genetik>tindakan untuk mengecualikan homeologous rekombinasi

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

7/15

Mechanism of MMR

CH3 CH35'3' 5'

3'

Initiation

CH3 CH35'

3' 5'

3'

CH3 CH35'

3' 5'

3'

MutS MutL MutH MutS MutL MutH

Excision

CH3 CH35'3' 5'

3'

CH3 CH35'3' 5'

3'

UvrD + RecJ or ExoIIUvrD + ExoI or Exo! or ExoII

Res"nt#esis

CH3 CH35'

3' 5'

3'

CH3 CH35'

3' 5'

3'

$o%III + %i&ase $o%III + %i&ase

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

8/15

Mechanism of MMR

CH3 CH35'3' 5'

3'

Initiation

CH3 CH35'

3' 5'

3'

CH3 CH35'

3' 5'

3'

MutS MutL MutH MutS MutL MutH

Excision

CH3 CH35'3' 5'

3'

CH3 CH35'3' 5'

3'

UvrD + RecJ or ExoIIUvrD + ExoI or Exo! or ExoII

Res"nt#esis

CH3 CH35'

3' 5'

3'

CH3 CH35'

3' 5'

3'

$o%III + %i&ase $o%III + %i&ase

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

9/15

Dasar dari pengenalan --,

-?T% dimer (dalam ragi! -sh0)-sh1 atau-sh0)-sh4 heterodimer*

Dengan e+pts mengikat DNA in :itro dan e+pts

DNA heteroduple+ perbaikan in :i:o> --,dapat mengenali semua substitusi dasarkecuali C> C dan pola perubahan lingkaranpendek F2 bp

Transisi pasangan yang salah G> T dan A> C dansatu basis loop sangat baik yang diakui (ini@uga kesalahan polimerase yang paling umum*

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

10/15

%truktur -ut% terikat DNA

Ikatan dalam DNA 4

-elebar alur kecil! menyempit alurutama

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

11/15

Perbaikan dengan pemotongan

nukleotida

-engenali lesi besar yang memblokir replikasi DNA(yaitu lesi yang dihasilkan oleh karsinogen* 8 contoh!?H photodimers pirimidin

Distorsi ?mum di heli+

%ayatan di kedua sisi lesi %edikit tambalan dari DNA dipotong! diperbaiki oleh

repolymerization dan ligasi

Pada E$ coli! dimediasi oleh ?:rA#CD

#anyak lagi protein yang terlibat dalam eukariota Dapat digabungkan ke transkripsi (TC,! transkripsi

ditambah perbaikan*

Cacat pada NE, mendasari eroderma pigmentosum

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

12/15

eroderma pigmentosum

-utasi resesi" autosomal dalambeberapa kelompok komplementasi

%ensiti:itas yang ekstrim terhadapsinar matahari

Becenderungan untuk kanker kulit(usia rata8rata kanker kulit < 7 thn :s

4 untuk populasi normal*

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

13/15

,ecognition and binding

?:rA acts as classical &molecularmatchmaker'

Incision

Nicks deli:ered 1/and 3/ to lesion by?:r#C

E+cision and repair

%hort "ragmentreleased byhelicase action

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

14/15

uman NE,

,ad.). ,ad0 in S. cerevisiae

7/23/2019 perbaikan ketidakcocokan.pptx

15/15