jigsaw asam nukleat - home group 10

Upload: odiliajessicanpvia

Post on 27-Feb-2018

237 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    1/14

    BLOK II. ILMU BIOMEDIK DASAR 1 (MAC 103)

    Jigsaw Asam Nukleat

    OlehHome Group 10Seksi B :

    Christianti / 2012 060 165

    Hans Christian / 2012 060 22

    !"hanes #eni Briant" / 2012 060 2

    $unike %"sasih / 2012 060 2&

    !"'ita ("tama / 2012 060 2&)

    *i+hael Sie Shun ,ing / 2012 060 2&-

    Angeli.ue *eiiawati Bura / 2012 060 256

    "mm / 2012 060 25-

    Jemm (unawan / 2012 060 262

    Juliana a3agukguk / 2012 060 26&

    4in+entius Henr Sunah / 2012 060 265

    $raim erinan"s Jam7"rmias / 2012 060 266

    *elania 8l"na 8n'i"lata nan" / 2012 060 26-

    #"sen 9engamu Asam Nukleat :

    #ra; ,ies %; ,AS %$#O%$AN

    >N84$S8AS %AO,8% 8N#ON$S8A A*A JA!A

    JA%AA2012

    Jigsaw Asam Nukla!

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    2/14

    1; *"lekul Asam Nukleat

    a; Jelaskan m"lekul?m"lekul em7entuk asam nukleat;

    7; Aa er7eaan antara nukle"sia an nukle"tia @

    +; Jelaskan 3uga +ara enamaanna;

    Jawa7 :

    *"lekul?m"lekul em7entuk asam nukleat aalah untaian sangat an3ang ang

    ihu7ungkan "leh ikatan "s"iester ang tersusun "leh nukle"tia; Nukle"tia tersusun

    atas k"m"nen aitu asam "sat= gula ent"sa an 7asa nitr"gen;

    Nukle"tia ter7entuk ari ikatan antara nukle"sia engan gugus "sat= seangkan

    nukle"sia meruakan ikatan antara gula ent"sa engan se7uah 7asa nitr"gen;

    Nama?nama nukle"tia isingkat men3ai k"e emat?huru stanar; Huru ertama

    7erua huru ke+il an menanakan 7ahwa nukle"tia ang iertanakan aalah

    se7uah ri7"nukle"tiar atau

    e"ri7"nu+le"ti ; Huru ke?2

    menanakan nukle"siaang

    7erhu7ungan engan nukle"7asa:

    (: (uanin

    A: Aenin

    : imin

    C: Sit"sin

    >:>rasilhana teraat aa NA

    Huru ke? an ke?& menanakan

    an3ang ari rantai "sat ang terikat

    *"n"?= #i?= ri? an ke7eraaanse7uah "sat 9;

    2; %"m"nen (ula #NA an NA

    a; (ula aa sa3a ang meruakan k"m"nen ang mem7entuk #NA an NA @7; (am7arkan struktur siklikna an en"meranna;

    Halaman " ari 1#

    http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ribonukleotida&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleobasahttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleobasahttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ribonukleotida&action=edit&redlink=1
  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    3/14

    Jawa7 :

    #NA an NA memunai susunan gula ent"sa masing?masing; (ula NA aalah

    ri7"sa; Sum7er gula ri7"sa alam sintesis 7i"kimia urin an irimiinna aalah 5?

    "s"ri7"sil ir""sat 999= ang 7erasal ari D?#?ri7"sa?5?"sat; (ula ini itemukan i

    seluruh m"lekul NA; Seangkan gula #NA aalah E?#?2F e"ksiri7"sa; (ula ini 7erasal

    ari rantai E?#?ri7"sa imana hir"ksil ?OH i "sisi ke?2 igantikan "leh hr"gen ?H;

    Se+ara 7i"kimia= r"ses ini aat ter3ai engan enGim ri7"nukle"tia reuktase ang

    mengu7ah ri7"nukle"sia i"sat alam reaksi reuksi kimia ari 2F OH men3ai 2F H;

    *enurut sistem enamaan struktur kimia= teraat 7e7eraa aturan alam menentukan

    en"meran; Jika gugus OH 7eraa i se7elah kanan= ikatakan 7entuk atau k"nigurasina

    aalah # eter= an 7ila 7eraa i se7elah kiri ise7ut 7entuk atau k"nigurasi , le'"us;

    Aturan lainna aalah at"m C1 ang men3ai C kiral sehingga mem7entuk is"mer 7aru=

    7er7ea alam hal letak/ "sisi ?OH lakt"l terhaa +in+in ang ter7entuk; 8s"mer ang

    7er7ea alam hal letak/ keuukan gugus ?OH lakt"l ini= i atas atau i 7awah +in+in

    inamakan an"mer; An"mer 7eta aalah untuk keuukan i atas= seangkan an"mer ala

    aalah untuk keuukan i 7awah; Selain itu= gula enusun NA ise7ut ri7"sa karena

    aat mem7entuk struktur siklik 7erangg"ta lima & at"m C an 1 at"m O;

    ;

    %"m"nen Basa Nitr"gen

    #NA an NA

    a; Se7utkan 7asa nitr"gen= 7aik urin mauun irimiin ang meruakan

    k"m"nenem7entuk#NA an NA;

    7; (am7arkan struktur m"lekulna serta tulis en"m"ranna;

    Jawa7 :

    Halaman 3 ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    4/14

    %"m"nen 7asa nitr"gen 9urin ang mem7entuk #NA aa Aenine A an (uanine

    (= seangkan aa 7asa nitr"gen 9irimiin teraat Ct"sine C an hmine ; 9aa

    NA= em7entuk k"m"nen 7asa nitr"gen 9urin sama engan #NA akni Aenine A an

    (uanine (; Namun aa 7asa nitr"gen 9irimiin teraat Ct"sine C an >ra+il >;

    9er7eaan inilah ang men3ai salah satu er7eaan antara #NA an NA 7erasarkan

    k"m"nen em7entukna; 9er7eaan antara hmine an >ra+il hana aa hmine ang

    memiliki kel"m"k metil;

    (am7ar struktur m"lekul an en"m"ran 7asa nitr"gen masing masing seerti i 7awah ini:

    a; 9urin

    1; Aenine A

    2; (uanine (

    7; 9irimiin

    1; Ct"sine C

    2; hmine

    Halaman # ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    5/14

    ; >ra+il >

    &; 8katan %imia *"lekul #NA

    a; Jelaskan +ara ter7entukna ikatan kimia ang aa aa struktur m"lekul #NA;7; Se7utkan 3uga nama ikatan terse7ut;

    +; #ari ikatan?ikatan terse7ut= ikatan ang mana ang mene7a7kan keua rantai #NA

    7erilin satu sama lain; Aakah ikatan ini meruakan ikatan hir"il atau hir""7@

    Jawa7 :

    8katan ang ter3ai aa asam nukleat aa

    tiga ma+am= aitu ikatan "s"iester= ikatan

    hir"gen an ikatan glik"siik; 8katan

    "s"iester meruakan ikatan k"'alen ang

    menghu7ungkan nukle"tia ang satu engan

    nukle"tia lainna melalui gugus "sat ang

    7eraa alam iester; 8katan ini menghu7ungkan

    antara gugus hir"ksil OH aa "sisi 5F gula

    ent"sa an gugus hir"ksil aa "sisi F gula

    ent"sa nukle"tia 7erikutna; Jai rantai "linukle"tia ihu7ungkan engan ikatan"s"iester;

    8katan glik"siik aalah ikatan ang ter3ai antara gula ent"sa engan 7asa nitr"gen;

    8katan ini sama engan ikatan ang ter3ai aa m"n"sakaria ang mem7entuk 3em7atan

    "ksigen; 8katan hir"gen aalah ikatan ang ter3ai antara 7asa nitr"gen ang satu engan

    7asa nitr"gen lain ang setara; C"nt"hna guanin an sit"sin memiliki tiga ikatan hir"gen

    seangkan aenin an timin memiliki ua ikatan hir"gen; >3ung ang 7erua gugus "sat

    Halaman $ ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    6/14

    meruakan u3ung 9 atau u3ung 5; Seangkan u3ung lainna 7erua gugus hir"ksil ang

    terikat aa gula ent"sa sehingga inamakan u3ung OH atau u3ung ;

    Struktur #NA 7erilin karena 7entukna ang antiaralel imana aa rantai se7elah

    kiri u3ung atasna aalah gugus "sat 5 seangkan ang rantai kanan atasna aalah gugus

    hir"ksil ; Hal ini 7erhu7ungan engan aana "larisasi an "sisi keseim7angan ang

    mana akan mem7entuk 7entukan heliks; Aaun tulang #NA ang tersusun ari "sat an

    gula ent"sa meruakan k"m"nen engan siat hir"ilik seangkan ikatan 7asa nitr"gen

    meruakan k"m"nen hir""7ik;

    5; 8katan Basa Nitr"gen #NA

    a; Jelaskan +ara em7entukan ikatan antara A an serta ( an C;

    7; *engaa 7asa?7asa aa #NA tiak aat 7erikatan engan 7aik aa double helix

    3ika urin 7erikatan engan urin atau irimiin engan irimiin;

    Jawa7 :

    8katan ang ter7entuk aa Aenin?imin an (uanin?Sit"sin ise7a7kan "leh aana

    ikatan hir"gen= aitu 2 ikatan hir"gen aa A? an ikatan hir"gen aa (?C; Cara

    em7entukan ikatan ini terlihat saat relikasi #NA; Setelah #NA rantai gana iutus ikatan

    hir"genna men3ai rantai tunggal menggunakan enGim helikase= na"limerase ang akan

    mem7entuk untaian #NA tunggal lainna; %emuian keua rantai ini akan isatukan

    menggunakan #NA ligase; 9em7entukan #NA rantai gana akan mem7entuk ikatan

    hir"gen antara gugus kar7"nil engan gugus amina an 3uga gugus amina engan gugus

    amina ang ise7a7kan "leh keelektr"negatian at"m O aa gugus kar7"nil an at"m N

    aa gugus amina;

    Halaman % ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    7/14

    9urin an irimiin se+ara sesiik ise7a7kan "leh strukturna ang miri engan te"ri

    kun+i an gem7"k alam em7entukan ikatan hir"genna= sehingga akan ter7entuk ikatan

    ang +uku kuat an sta7il; Seangkan 7ila aa #NA= urin 7erikatan engan urin an

    irimin engan irimiin= tiak akan ter7entuk ikatan hir"gen ang sta7il karena

    ketiak+"+"kan aa strukturna terse7ut imana ikatan hir"gen antara gugus kar7"ksil

    engan gugus amina tiak aat ter7entuk; 9eristiwa ini ise7ut 3uga mismat+h an 7iasana

    akan segera ier7aiki "leh rNA;

    6; antai 9asangan Struktur antai #NA

    a; Jelaskan 7agaimana urutan 7asa ari rantai ang satu memengaruhi urutan 7asa

    rantai asanganna aa struktur #NA;

    7; Jika urutan 7asa aa salah satu rantai #NA aalah: 5F?A(ACC(AAAC?F=

    7agaimana urutan 7asa aa rantai asanganna@

    Jawa7 :

    #NA memunai struktur "u7le heli ang meruakan ita siral ang saling

    7erilin; Bentuk utas gana itu tersusun "leh 2 rantai "linukle"tia ang saling 7erilin aa

    aksis ang sama; (ugus gula "sat meruakan kerangka ari m"lekul an teraat aa

    7agian luar; Basa nitr"gen aa untaian nukle"tia 7erikatan engan 7asa nitr"gen untaian

    lainna melalui ikatan hir"gen;

    Basa nitr"gen urin akan 7erikatan engan 7asa nitr"gen irimiin= sehingga (

    guanin akan selalu 7erikatan engan C sit"sin= an A aenin akan selalu 7erikatan

    engan timin; Hal terse7ut mene7a7kan urutan 7asa nitr"gen untaian ang satu

    menentukan urutan 7asa nitr"gen untaian ang selan3utna an keuana 3uga saling

    melengkai;>rutan 7asa aa rantai asangan #NA 5F?A(ACC(AAAC?F aalah F

    ?AC((AC(? 5F;

    ); Struktur antai #NA an NA

    a; Jelaskan tiga er7eaan struktur #NA an NA;

    Jawa7 :

    Halaman & ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    8/14

    Struktur #NA an NA memunai er7eaan= walauun sama?sama memunai

    eran enting alam kehiuan manusia; 9er7eaan utama mereka terletak i gula

    enusunna= aitu 7agian ent"sa; Bagian gula ent"sa NA aalah ri7"sa= seangkan gula

    ent"sa #NA aalah e"ksiri7"sa; Selain itu= salah satu er7eaan ang +uku signiikan

    aalah 7entuk m"lekul #NA aalah heliks gana= seangkan 7entuk m"lekul NA 7erua

    rantai tunggal ang terliat; 9er7eaan antara #NA an NA lainna aalah g"l"ngan

    irimiin NA ang menganung sit"sin an urasil= 7er7ea engan #NA= g"l"ngan

    irimiinna menganung sit"sin an timin;

    I; ie NA

    Jelaskan mengenai struktur= k"m"sisi enusun= serta ungsi ari:

    a; mNA

    7; tNA

    +; rNA

    Jawa7 :

    Halaman ' ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    9/14

    mRNA

    *essenger NA atau NA uta NA aalah tie NA ang mem7awa in"rmasi

    genetik ari inti #NA ke sit"s"l= imana akan igunakan se7agai template/ +etakan untuk

    sintesis r"tein; mNA meruakan N!A ang urutan 7asana k"mlementer 7erasangan

    engan salah satu urutan 7asa rantai #NA; NA 3enis ini meruakan "linukle"tia

    7er7entuk ita tunggal linear an isintesis "leh #NA i alam nuklues; #alam NA= mNA

    hana teraat sekitar 2?5 sa3a an aling heter"gen 7aik alam ukuran= sta7ilitas= an

    urutan 7asa enusunna; Aa7ila mNA mem7awa in"rmasi gen le7ih ari satu= maka

    inamakan "lisistr"nik; Namun= aa7ila hana satu gen= maka inamakan m"n"sistr"nik;

    Se7agaimana teraat aerah translasi r"tein= mNA teriri ari aerah ang tiak aat

    itranslasi aa u3ung 5F an u3ung F; %arakteristik struktural khusus aa mNA sel

    eukari"tik termasuk urutan an3ang 7erua &0 200 aenin nukel"tia ek"r "l?A aa

    u3ung F rantai NA= itam7ah se7uah KkealaL aa u3ung 5F ang teriri ari m"lekul )?

    metilguan"sin tri"sat ang melekat ke 7elakang 5F5F ang 7erekatan engan 2F?O?

    Halaman ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    10/14

    metil ri7"nukle"sia aa 5F?hir"ksil?na melewati sam7ungan tri"sat; *"lekul ini

    teraat 6?metilaenil an 2F?O?ri7"sa metil nukle"tia; MkealaF ini 7erungsi untuk

    engenalan mNA aa translasi an mensta7ilisasi mNA engan men+egah serangan

    enGim 5F?e"nuklease;

    !RNA

    ranser NA aalah tie NA engan ukuran terke+il &S ari ketiga tie NA

    ang 7erlaku se7agai m"lekul Maat"rF ang mem7awa asam amin" sesiik ke temat

    sintesis r"tein; NA 3enis ini i7entuk i alam nukleus= tetai menematkan iri i alamsit"lasma; tNA meruakan NA terenek an 7ertinak se7agai ener3emah k""n ari

    mNA;Baik sel eukari"t mauun r"kari"t= tNA i keuana i7entuk ari m"lekul

    se7elumna ang an3ang an harus im"iikasi; eraat aling tiak satu tie sesiik ari

    sekitar 50 m"lekul tNA untuk setia ari 20 3enis asam amin" aa r"tein; tNA ini

    teraat aa NA se7anak sekitar 15?20; *"lekul tNA 7erisi 7asa ang tiak 7iasa an

    memunai r"ngga antar rantai enusunna an asangan antar 7asa; tNA ini melekat

    aa u3ung F se+ara k"'alen; Setia m"lekul tNA memiliki 7agian untuk menemel untuk

    setia asam amin" aa u3ung F; 9aa gugus kar7"ksil asam amin" ialah sam7ungan ester

    Halaman 10 ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    11/14

    engan F?hir"ksil ari 7agian ri7"sa aa aen"sin nukle"tia; Amin" a+i ang menemel

    engan tNA ikatakan terakti'asi; Selain itu= tNA 7erisi urutan 7asa nukle"tia

    antik""n ang mengenali k""n sesiik aa mNA; %""n itu mem7antu

    mensesiikasi enisian ke rantai asam amin"; eraat & lengan aa tNA= aitu lengan

    enerima= lengan # ihir"ura+il= lengan C seu"ura+il= an lengan ekstra ang

    mem7antu mensesiikan tNA;

    RNA

    i7"s"mal NA itemukan alam kumulan ari 7e7eraa r"tein se7agai k"m"nen

    ari ri7"s"m ang meruakan sruktur k"mleks ang mem7antu se7agai temat sintesis

    r"tein;NA ini 7erua ita tunggal= tiak 7er+a7ang= an leksi7el; Jai= ungsi ari rNA

    ini seniri se"lah "lah men3ai Ma7rikF untuk sintesis r"tein; rNA ter7entuk ari sintesis

    m"lekul se7elumna ang an3ang ang ise7ut reri7"s"mal NAs; 9aa sel r"kari"tik=

    unit ri7"s"m se7esar )0S memiliki 2 su7unit 7esar 50S an ke+il 0S; *asing masing

    Halaman 11 ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    12/14

    su7unit teraat er7eaan ukuran= ari su7unit 7esar 2S an 5S an ari su7unit ke+il

    16S; Seangkan aa sel eukari"tik= unit ri7"s"m se7esar I0S ang tere+ah men3ai 2

    su7unit= akni su7unit 7esar 60S an ke+il &0S; Su7unit 7esar tere+ah men3ai 2IS=

    5;IS= an 5S an su7unit ke+il men3ai 1IS;

    >kuran untuk 7erat m"lekular an 7entuk senawa iakai satuan unit S'e7erg S;

    Su7unit 7esar 7erungsi unutk mengkatalis em7entukan ikatan etia; Seangkan= su7unit

    ke+il untuk mengikat mNA mem7entuk "lis"m an 7ertanggung 3awa7 aa keakuratan

    aa translasi engan men3amin asangan 7asa engan 7enar antara k""n i mNA an

    antik""n i tNA; 9aa NA seluruhna= rNA teraat )0?I0; Be7eraa rNA

    7erungsi se7agai katalis alam sintesis r"tein;

    -; Struktur 9rimer an Sekuner

    a; Jelaskan mengenai struktur rimer an struktur sekuner #NA;

    7; Jelaskan mengenai struktur rimer an struktur sekuner NA;

    Jawa7 :

    Struktur rimer #NA aalah struktur ang

    memerlihatkan aana m"n"mer ? m"n"mer asam

    nukle"tia ang teriri ari "sat= gula ent"sa= an

    7asa nitr"gen; Basa nitr"gen aat 7erua urin

    atau irimiin; Struktur rimer #NA

    memerlihatkan se+ara 3elas ikatan ? ikatan ang

    ter3ai seerti gam7ar i saming;

    Struktur sekuner memerlihatkan aana 7entukan "u7le heliks imana gula ent"sa an"sat men3ai tulang terluarna seangkan 7asa nitr"gen men3ai ikatan tengahna; Heliks

    gana terse7ut tersusun ari ua untai "linukle"tia se+ara antiaralel arah 5F F saling

    7erlawanan= 7erutar ke kanan an melingkari suatu sum7u; erlihat seerti gam7ar kiri i

    atas;

    Struktur 9rimer NA teraat se7agai utas tunggal an meruakan rantai ri7"nukle"tia

    memiliki tulang unggung gugus ri7"sa an asam "sat se+ara 7ergantian; Sama halna

    engan #NA= NA 3uga memiliki 7asa nitr"gen urin an irimiin ang terikat engan

    gugus ri7"sa; 8katan "s"iester menghu7ungkan gugus hir"ksi aa nukle"tia ang

    Halaman 1" ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    13/14

    satu engan gugus hir"ksi 5 aa nukle"tia lainna; 9aa asarna 7asa nitr"gen ang

    imiliki #NA an NA aalah sama namun er7eaanna aalah aa NA tiak itemukan

    timin melainkan urasil; %anungan aenin tiak sama engan kanungan urasil= 7egituula

    kanungan guanin an sit"sin; 9er7eaanna engan struktur rimer #NA aalah gula

    ent"sa NA aalah ri7"nukleat seangkan #NA aalah 2?e"ksiri7"nukleat= an aa NA

    teraat urasil seangkan alam #NA teraat timin;

    Struktur sekuner NA ter7entuk aa7ila struktur rimerna meliat iri sehingga

    mem7entuk utas rangka namun tiak mem7entuk heliks;

    10; 9er7aningan Basa Nitr"gen

    a; Jelaskan mengaa 3ika #NA ihir"lisis= er7aningan antara A : an ( : C selalu

    menekati 1 : 1;

    Jawa7 :

    9aa saat #NA ihir"lisisakan terlihat selalu er7aningan antara A engan serta C

    engan ( aalah sekitar 1:1 sesuai engan hukum Charga; Hal ini aat ter3ai karena

    #NA memiliki gugus "u7le heliks ang imana aa setia nukle"tia #NA teraat

    seasang 7asa nitr"gen aitu aen"sin engan timin an sit"sin engan guanin= maka ari itu

    er7aningan A? an C?( akan selalu menekati 1:1; Seanaina ter7entuk ikatan

    nukel"tia ang tiak sesuai= #NA segera akan mengatasina engan 7er7agai +ara

    tergantung keaaanna aitu= mismatch reapir, bas excision repair, nucleotide excision repair

    andouble strand break repair.

    Halaman 13 ari 1#

  • 7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10

    14/14

    DA*+AR ,US+AKA

    1; Har'e A= errier #; ,iin+"ttFs illustrate re'iews= 7i"+hemistr; &th e;9hilaelhia: